L’origine de ce titre remonte à Henri IV, protestant converti au catholicisme pour monter sur le trône de France. En 1604, Henry IV offre à Rome l’abbaye bénédictine de Clairac, dans le Lot. En remerciement, le pape lui octroie le titre de chanoine de la basilique Saint-Jean-de-Latran, transmis depuis aux chefs d’État français.
Ce titre a progressivement perdu de son importance avant d’être réinvesti en 1957 par René Coty. Depuis, plusieurs Présidents, comme de Charles de Gaulle, Valéry Giscard d’Estaing, Jacques Chirac, Nicolas Sarkozy et Emmanuel Macron ont pris possession de ce titre, tandis que Georges Pompidou, François Mitterrand et François Hollande ne l’ont pas fait.
Le président de la République détient plusieurs autres titres honorifiques de chanoine, dont certains sont inactifs, comme celui de proto-chanoine de la cathédrale Notre-Dame-du-Réal d’Embrun. Il est également proto-chanoine de la basilique Notre-Dame de Cléry et chanoine d’honneur de diverses cathédrales et églises, bien que ces titres soient principalement symboliques.